58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1220 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.699569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0988  hypothetical protein  83 
 
 		 100 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4671  protein of unknown function DUF1244  77.89 
 
 		 99 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5967  protein of unknown function DUF1244  75.51 
 
 		 101 aa  163  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1425  hypothetical protein  76.04 
 
 		 97 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1404  hypothetical protein  75.79 
 
 		 97 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5201  hypothetical protein  69.39 
 
 		 101 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2871  protein of unknown function DUF1244  70.1 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2749  hypothetical protein  69.7 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2976  protein of unknown function DUF1244  69.7 
 
 		 102 aa  150  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0124  hypothetical protein  70.53 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6867  hypothetical protein  75 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0188291  normal  0.0230228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3292  protein of unknown function DUF1244  67.39 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3593  protein of unknown function DUF1244  66.3 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22377  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0179  hypothetical protein  62.63 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2033  hypothetical protein  63.16 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0940  hypothetical protein  60.82 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2679  hypothetical protein  64.04 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.701698  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0505  protein of unknown function DUF1244  59.6 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3693  hypothetical protein  64.13 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0807  hypothetical protein  64.13 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4618  hypothetical protein  64.13 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1688  hypothetical protein  60.42 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19610  hypothetical protein  60.42 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4494  hypothetical protein  61.7 
 
 		 97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1018  hypothetical protein  61.46 
 
 		 99 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1180  hypothetical protein  63.54 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.887968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4633  hypothetical protein  63.04 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0445  hypothetical protein  56.12 
 
 		 98 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10250  hypothetical protein  59.57 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0889  hypothetical protein  58.59 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3253  hypothetical protein  63.1 
 
 		 94 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0327  protein of unknown function DUF1244  58.59 
 
 		 100 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0421586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0510  hypothetical protein  57.89 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00903  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00704885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0910  hypothetical protein  61.63 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.481473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3291  hypothetical protein  58.95 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6558  protein of unknown function DUF1244  63.75 
 
 		 81 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.45897  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1918  hypothetical protein  58.95 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004018  protein of unknown function DUF1244  60.92 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0226  protein of unknown function DUF1244  56.99 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0609  hypothetical protein  56.84 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2333  hypothetical protein  55.68 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1761  hypothetical protein  53.61 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.530728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01447  hypothetical protein  59.09 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2828  hypothetical protein  58.7 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1293  hypothetical protein  54.95 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2137  hypothetical protein  59.52 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.643162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1647  hypothetical protein  52.63 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.205774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0621  hypothetical protein  56.04 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3910  hypothetical protein  61.46 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3170  hypothetical protein  55.79 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01819  Deoxycytidine triphosphate deaminase  54.74 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0173168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2363  deoxycytidine triphosphate deaminase  55.95 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0212261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1549  hypothetical protein  56.47 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00160106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0431  hypothetical protein  51.09 
 
 		 102 aa  97.1  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0340  hypothetical protein  49.48 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0442242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.33 
 
 		 345 aa  40  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>