18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0299 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0299  HNH endonuclease  100 
 
 		 162 aa  340  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0208  HNH endonuclease  39.26 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6243  putative endonuclease  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000281378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0880  HNH endonuclease  51.72 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1778  hypothetical protein  34.17 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.448139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2362  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00840097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1838  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  35.29 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393326  hitchhiker  0.000166826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4092  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  31.68 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4536  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF  36.36 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408685  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3200  pathogenesis-related transcriptional factor and ERF protein  31.39 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4224  hypothetical protein  38.46 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000588859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4702  hypothetical protein  48.65 
 
 		 279 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1578  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3832  NUMOD4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000542576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_3001  endonuclease  34.92 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4975  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4680  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  0.79747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4592  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>