22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5175 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  100 
 
 		 142 aa  268  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  57.94 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  44.37 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  46.04 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  46.03 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  41.48 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  34 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  40.6 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  37.98 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  37.68 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  40 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  31.11 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  36.76 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  36.76 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  34.88 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  30.47 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  36.96 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4097  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.799552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3447  protein of unknown function DUF350  40 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.401801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1221  hypothetical protein  27.08 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>