26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5024 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5024  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1960  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1914  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1894  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.407369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2527  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00497835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531234  normal  0.0179673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6490  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.543619  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.74 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0358848  normal  0.992852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3203  hypothetical protein  27.66 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1686  hypothetical protein  30.1 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1704  hypothetical protein  30.1 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.653173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3919  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3069  hypothetical protein  26.32 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1850  hypothetical protein  28.41 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0761  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.91 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635476  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2086  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.91 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4752  hypothetical protein  31.87 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1591  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768665  normal  0.0150332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2214  hypothetical protein  25.56 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1305  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.675422  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6156  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14711  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000210055  hitchhiker  0.00000000162299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4359  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
269 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>