19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4795 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  57.85 
 
 
251 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  40.17 
 
 
265 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  42 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
735 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  43.15 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  38.86 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  43.62 
 
 
277 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  38.24 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  39.66 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  35.89 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  39.37 
 
 
268 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  34.62 
 
 
283 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  30.05 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  29.15 
 
 
280 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  30.53 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0807  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  24.31 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07681  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0997365  hitchhiker  0.000779865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>