18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4375 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4375  thiamineS protein  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  62.35 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.82 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  48.24 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  48.19 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  45.45 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  50 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  50.59 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  41.67 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  50.59 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  39.08 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  38.89 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1243  hypothetical protein  39.56 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00015012  normal  0.456438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  52.5 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  48.33 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  42.35 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  42.11 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 		 223 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>