17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4259 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4259  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4404  hypothetical protein  60.98 
 
 
164 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9030  hypothetical protein  58.28 
 
 
165 aa  187  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779481  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4232  hypothetical protein  54.32 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1143  hypothetical protein  53.94 
 
 
166 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4504  hypothetical protein  50.3 
 
 
164 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6190  hypothetical protein  41.32 
 
 
166 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0571  hypothetical protein  42.5 
 
 
163 aa  121  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05960  hypothetical protein  43.51 
 
 
165 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.534125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3736  hypothetical protein  37.04 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3938  hypothetical protein  36.88 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3308  hypothetical protein  42.52 
 
 
166 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2814  hypothetical protein  42.06 
 
 
161 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4464  hypothetical protein  32.85 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3729  hypothetical protein  37.82 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0248179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0469  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0201  hypothetical protein  35.25 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>