11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3580 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3580  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  345  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1775  hypothetical protein  49.21 
 
 
197 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.741384  normal  0.308544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4789  hypothetical protein  48.13 
 
 
194 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368691  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3081  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2053  hypothetical protein  40.21 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00648458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3484  hypothetical protein  39.53 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3434  major facilitator transporter  37.37 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0145868  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3069  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0580303  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2985  hypothetical protein  36.32 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000610885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3400  hypothetical protein  39.23 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30990  hypothetical protein  29.85 
 
 
215 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.115562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>