14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2299 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2299  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5635  hypothetical protein  73.21 
 
 
211 aa  314  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4678  hypothetical protein  72.22 
 
 
215 aa  312  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1558  hypothetical protein  62.98 
 
 
245 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46145  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1277  hypothetical protein  63.77 
 
 
211 aa  267  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.271248  normal  0.758218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3735  hypothetical protein  60.93 
 
 
209 aa  256  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4614  hypothetical protein  56.95 
 
 
225 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2089  hypothetical protein  54.22 
 
 
230 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4093  hypothetical protein  54.05 
 
 
224 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4169  hypothetical protein  54.05 
 
 
224 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4323  hypothetical protein  54.05 
 
 
224 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal  0.117696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11141  hypothetical protein  51.68 
 
 
286 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3376  hypothetical protein  53.12 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1503  hypothetical protein  77.05 
 
 
98 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>