19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2079 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2079  Domain of unknown function DUF1801  100 
 
 
150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0297995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8844  hypothetical protein  75.86 
 
 
146 aa  235  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  60 
 
 
152 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3434  hypothetical protein  59.03 
 
 
156 aa  167  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0744496  normal  0.059661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  55.86 
 
 
157 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1178  hypothetical protein  58.78 
 
 
128 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0555  hypothetical protein  55.1 
 
 
156 aa  156  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  53.74 
 
 
146 aa  155  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2173  hypothetical protein  56.03 
 
 
161 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.294686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2344  hypothetical protein  54.86 
 
 
160 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612858  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3371  hypothetical protein  51.68 
 
 
161 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0511  hypothetical protein  50.36 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1217  hypothetical protein  52.17 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.889377  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4098  hypothetical protein  51.77 
 
 
160 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.369529  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0788  hypothetical protein  46.75 
 
 
180 aa  117  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571735  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19540  protein of unknown function (DU1801)  34.96 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275996  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22220  protein of unknown function (DU1801)  35.25 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2458  Domain of unknown function DUF1801  59.52 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0934396  hitchhiker  0.00000261825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3419  hypothetical protein  29.17 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>