36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4772 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  100 
 
 
758 aa  1462    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  44.99 
 
 
747 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  42.54 
 
 
751 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  40.4 
 
 
764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  40.53 
 
 
764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  40.45 
 
 
739 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  39.89 
 
 
751 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  40 
 
 
748 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  40.29 
 
 
756 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  38.89 
 
 
752 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  35.62 
 
 
777 aa  353  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  37.74 
 
 
790 aa  341  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  35.08 
 
 
820 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  35.73 
 
 
820 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  35.91 
 
 
759 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  35.08 
 
 
837 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  36.95 
 
 
789 aa  309  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  34.73 
 
 
789 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  39.81 
 
 
857 aa  298  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  37.27 
 
 
726 aa  297  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  36.75 
 
 
758 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  37.34 
 
 
761 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  35.69 
 
 
876 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  31.85 
 
 
834 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  30.13 
 
 
826 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  40.36 
 
 
745 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  37.17 
 
 
817 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.29 
 
 
779 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  39.84 
 
 
953 aa  198  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  34.24 
 
 
762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.65 
 
 
822 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  28.24 
 
 
840 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  31.64 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  29.52 
 
 
798 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  29.52 
 
 
856 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  22.69 
 
 
557 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>