30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4752 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  100 
 
 		 100 aa  196  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  48.91 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  44.9 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  41.49 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  50.52 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  44.44 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  50.52 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  50.52 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  54.55 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  51.09 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  47.25 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  51.09 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  46.32 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  44.64 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  49.18 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  49.46 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.13 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  41.11 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  42.11 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  55.56 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  36.96 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  38.89 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  42.11 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.04 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.96 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  35.87 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  34.62 
 
 		 92 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  42.37 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.96 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  46.58 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>