13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4735 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4735  VanZ family protein  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3210  VanZ family protein  33.56 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4053  VanZ family protein  41.84 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2952  VanZ family protein  34.95 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0115  VanZ family protein  36.09 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.409766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1422  VanZ family protein  43.82 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  22.96 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4233  hypothetical protein  39 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.412225  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  38.82 
 
 		 344 aa  42.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C11  glycopeptide antibiotics resistance protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  29.73 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 669 aa  41.2  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.774889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>