17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3117 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  51.34 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  51.22 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  51 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  44.49 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  43.95 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  44.31 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  35.89 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 		 735 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  39.77 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  39.68 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  32.22 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  28.4 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  35.47 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  28.9 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  23.61 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>