12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2036 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2036  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  490  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  hitchhiker  0.00824459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3253  hypothetical protein  38.53 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  33.8 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  30.66 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  31.18 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  27.35 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  28.81 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  23.63 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  30.61 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  30.61 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  27.16 
 
 
287 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  30.99 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>