35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5054 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  76.15 
 
 
739 aa  1040    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  76.51 
 
 
764 aa  1056    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1446    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  76.51 
 
 
764 aa  1057    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  82.22 
 
 
748 aa  1134    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  64.14 
 
 
756 aa  869    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  42.3 
 
 
777 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  44.2 
 
 
751 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  39.49 
 
 
758 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  41.7 
 
 
747 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  41.77 
 
 
726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  41.39 
 
 
752 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  37.03 
 
 
837 aa  360  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  37.44 
 
 
790 aa  333  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  38.3 
 
 
820 aa  328  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  37.07 
 
 
820 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  38.94 
 
 
758 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  40.8 
 
 
857 aa  317  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  36.27 
 
 
759 aa  313  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  37.72 
 
 
876 aa  310  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  34.85 
 
 
789 aa  310  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  36.55 
 
 
789 aa  283  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  35.37 
 
 
761 aa  280  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  35.35 
 
 
826 aa  254  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  34.4 
 
 
834 aa  250  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  34.91 
 
 
762 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  37.28 
 
 
817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  38.77 
 
 
953 aa  198  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  38.56 
 
 
745 aa  180  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  31.19 
 
 
798 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.66 
 
 
822 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  28.11 
 
 
840 aa  154  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  31.88 
 
 
779 aa  154  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  29.4 
 
 
719 aa  130  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  36.07 
 
 
856 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>