38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5048 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  100 
 
 		 88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  71.95 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  64.77 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  66.27 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  64.77 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  64.77 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  60.98 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  51.16 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  49.38 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  53.09 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  55.42 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  56.41 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  53.49 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  47.62 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  46.59 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  42.5 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  46.32 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  50.79 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  40.82 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  45.68 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  47.06 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.86 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  50.62 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.75 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  46.91 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  43.18 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  42.35 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.75 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.67 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  37.31 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  45.76 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  34.09 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0179  thiamineS protein  36.14 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0922394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.29 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.36 
 
 		 91 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>