53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3057 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  86.2 
 
 		 565 aa  959    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  80.39 
 
 		 563 aa  906    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1131    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  80.39 
 
 		 563 aa  906    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  80.39 
 
 		 563 aa  906    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.26 
 
 		 584 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.47 
 
 		 559 aa  608  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  51.28 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  50.18 
 
 		 594 aa  549  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  45.49 
 
 		 576 aa  521  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  50.47 
 
 		 574 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  50.47 
 
 		 601 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  50.47 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  45.22 
 
 		 600 aa  488  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  48.96 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  48.96 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  48.96 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  48.96 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  37.96 
 
 		 563 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  34.07 
 
 		 560 aa  299  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.01 
 
 		 572 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 580 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  36.41 
 
 		 587 aa  289  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.01 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  38.94 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  36.46 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  35.46 
 
 		 578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  34.48 
 
 		 568 aa  267  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 525 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  40.05 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  35.23 
 
 		 581 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  33.27 
 
 		 621 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 601 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.43 
 
 		 625 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 533 aa  217  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 625 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 623 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 625 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  30.7 
 
 		 577 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 506 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  26.61 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 		 530 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  27.12 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.48 
 
 		 871 aa  70.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 750 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 3172 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1049 aa  44.3  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>