14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0042 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0062  tRNA-Asn  86.9 
 
 		 73 bp  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0042  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0045  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.112138  normal  0.31939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0048  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0005  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0064  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.468559  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0005  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.150884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0007  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0934389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0477959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>