13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1552 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  100 
 
 		 594 aa  1229    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  53.55 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  52.26 
 
 		 601 aa  617  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  23.11 
 
 		 606 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  24.53 
 
 		 604 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  21.54 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  24.1 
 
 		 1421 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  23.45 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  22.52 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  21.05 
 
 		 1413 aa  60.8  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  27.34 
 
 		 699 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  23.83 
 
 		 548 aa  47.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 402 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>