25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1240 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.498163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  68.09 
 
 		 55 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  61.36 
 
 		 54 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  56.25 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  50 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  50 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  46.43 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  52.27 
 
 		 50 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  50 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  56.1 
 
 		 46 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  45.45 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  45.45 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  57.5 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  54.55 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  54.55 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  56.82 
 
 		 52 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4645  protein CoxF  55.74 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0853547  normal  0.0948829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  60 
 
 		 45 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  45.65 
 
 		 46 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0476  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.288807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0470  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0584  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000268362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2231  hypothetical protein  40.82 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775503  hitchhiker  0.0077658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  54.55 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>