42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1659 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1659  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  649    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.724868  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1904  SpoVT/AbrB domain protein  49.4 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365247  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  31.58 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 351 aa  92.8  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  27.08 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  25.51 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  30.89 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  26.29 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  27.46 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  28.49 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  29.26 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  28.93 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  21.01 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.282043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  25.68 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  29.66 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  22.68 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  27.81 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  23.65 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  21 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  28.47 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  26.06 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  24.16 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  22.17 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.198015 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  23.68 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  26.67 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  25.83 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  27.42 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  23.4 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  22.78 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  20.22 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  20.11 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  21.28 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  25.35 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3556  SpoVT/AbrB domain protein  19.49 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0532  SpoVT/AbrB domain-containing protein  23.18 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1109  SpoVT/AbrB domain-containing protein  22.13 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.235676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0507  SpoVT/AbrB domain-containing protein  25.62 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.134191  normal  0.166881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>