30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5431 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5431  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0464823  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6496  hypothetical protein  56.92 
 
 
181 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4695  hypothetical protein  53.5 
 
 
199 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5238  hypothetical protein  58.29 
 
 
201 aa  151  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5160  hypothetical protein  52.76 
 
 
198 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5879  hypothetical protein  60.42 
 
 
191 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2569  hypothetical protein  49.72 
 
 
253 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1827  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1435  hypothetical protein  62.89 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3946  hypothetical protein  65.52 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2893  hypothetical protein  76.47 
 
 
276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2852  hypothetical protein  75 
 
 
258 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4236  hypothetical protein  65.15 
 
 
314 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333237  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3005  hypothetical protein  40.71 
 
 
219 aa  87.8  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.491435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1570  hypothetical protein  34.8 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2242  hypothetical protein  35.08 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2684  hypothetical protein  47.87 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0939  hypothetical protein  34.5 
 
 
243 aa  82  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0946  hypothetical protein  34.5 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1724  hypothetical protein  45.35 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0136792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1150  hypothetical protein  55.88 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1689  hypothetical protein  52.24 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1474  hypothetical protein  50.75 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.656718  normal  0.108211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1673  hypothetical protein  50.75 
 
 
289 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1782  hypothetical protein  37.23 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1004  hypothetical protein  32.87 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2149  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0185  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2263  hypothetical protein  55.81 
 
 
141 aa  52  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.637535  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1095  hypothetical protein  60.53 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>