15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5028 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  62.76 
 
 
189 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  58.62 
 
 
190 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  42.67 
 
 
154 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  42.96 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  39.58 
 
 
152 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  36.91 
 
 
153 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  36.69 
 
 
149 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  35.03 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  34.23 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  29.46 
 
 
121 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  29.41 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  28.95 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  36.71 
 
 
127 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>