22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1484 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  57.97 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  57.14 
 
 
159 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  57.14 
 
 
159 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  58.46 
 
 
163 aa  140  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6821  hypothetical protein  55.28 
 
 
172 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  43.56 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0739  hypothetical protein  47 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740203  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  29.17 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0536  hypothetical protein  42.19 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  30.89 
 
 
182 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  28.83 
 
 
274 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  28.83 
 
 
274 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  25.25 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  25.81 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30.3 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  32.67 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5261  putative nutrient deprivation-induced protein  32.18 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  30.68 
 
 
319 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  28.87 
 
 
321 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  28.91 
 
 
220 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>