19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3456 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  100 
 
 		 54 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  90.74 
 
 		 54 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  90.74 
 
 		 54 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  74.07 
 
 		 50 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  70.37 
 
 		 54 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  56.6 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  74.07 
 
 		 50 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  48.33 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  59.09 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  57.41 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  57.41 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  56.82 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  56.82 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  56.82 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1240  hypothetical protein  56.25 
 
 		 58 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.498163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  47.37 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  44.74 
 
 		 46 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  48.94 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4645  protein CoxF  63.27 
 
 		 61 aa  40  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0853547  normal  0.0948829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>