17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1827 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  190  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  86.32 
 
 
92 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  85.26 
 
 
92 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  51.9 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  45.63 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  41.25 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  43.53 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  41.77 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  42.5 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  42.35 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  40.48 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  39.51 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  41.46 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>