54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0701 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  100 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  95.12 
 
 
205 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  94.63 
 
 
205 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  76.85 
 
 
208 aa  329  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  68.16 
 
 
208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  66.83 
 
 
207 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  67.33 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  63.5 
 
 
205 aa  272  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  67.34 
 
 
207 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  56.85 
 
 
205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  53.06 
 
 
208 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  52.55 
 
 
208 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  51.55 
 
 
208 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  51.55 
 
 
208 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  52.06 
 
 
208 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  52.06 
 
 
208 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  51.55 
 
 
208 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  51.03 
 
 
208 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  51.03 
 
 
443 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  49.49 
 
 
208 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  53.3 
 
 
205 aa  198  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  44.5 
 
 
212 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  44.39 
 
 
218 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  41.24 
 
 
199 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  42.25 
 
 
198 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  39.18 
 
 
217 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  38.02 
 
 
226 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  35.35 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  37.89 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  34.02 
 
 
228 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  32.84 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  29.29 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  27.92 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  27.27 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  26.47 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  27.49 
 
 
380 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  27.01 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  26.07 
 
 
380 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  29.27 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  25.12 
 
 
378 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  25.12 
 
 
378 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  24.64 
 
 
378 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  24.64 
 
 
378 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  24.17 
 
 
305 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>