23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3273 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  63.77 
 
 
332 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  60.89 
 
 
316 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  52.73 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  54.71 
 
 
317 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  38.46 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  38.96 
 
 
353 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  36.36 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  37.31 
 
 
336 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  36.16 
 
 
335 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 
331 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  32.2 
 
 
342 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  33.88 
 
 
342 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  35.37 
 
 
322 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  36.19 
 
 
351 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  34.34 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  40.91 
 
 
364 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 
321 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  35.11 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  24.59 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>