32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0024 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0024  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.683593  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0040  5S ribosomal RNA  99.16 
 
 		 119 bp  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.344564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0037  5S ribosomal RNA  99.16 
 
 		 119 bp  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.234158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0041  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 122 bp  97.6  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.541052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0036  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 122 bp  97.6  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.380144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0023  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 122 bp  97.6  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451348  normal  0.87366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0043  5S ribosomal RNA  82.86 
 
 		 122 bp  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0039  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 121 bp  61.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0050  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0026  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 120 bp  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0005  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0004  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0024  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0064  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0065  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0069  5S ribosomal RNA  96.3 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1618  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.636533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0077  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0062  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 121 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000016841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1583  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1803  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000167597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0011  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 120 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1797  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 119 bp  44.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.20962e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1781  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 127 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.386687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0412  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 124 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0961397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0184  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 127 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00848557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0171  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 124 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.114955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0082  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 124 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0022  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 124 bp  44.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0311578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>