38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2196 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 362 aa  749    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  78.45 
 
 		 362 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  74.86 
 
 		 362 aa  587  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  72.75 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  72.78 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  63.87 
 
 		 369 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  61.77 
 
 		 373 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.26 
 
 		 364 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.01 
 
 		 366 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.94 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  59.5 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  59.5 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  61.06 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.18 
 
 		 362 aa  404  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  40 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  38.31 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  40.23 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  39.65 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  39.36 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  32.84 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  29.67 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  31.59 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  30.49 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  28.02 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  27.75 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  30.34 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  27.47 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  29.58 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  29.21 
 
 		 367 aa  162  7e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  29.21 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  29.69 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.27 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  28.06 
 
 		 430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  28.52 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  25.17 
 
 		 432 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  23.41 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  27.06 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  25.95 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>