21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7552 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7552  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0606564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6821  hypothetical protein  78.24 
 
 		 172 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1484  hypothetical protein  57.97 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000292957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1830  hypothetical protein  48.12 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1551  hypothetical protein  48.12 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.670721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1690  hypothetical protein  48.48 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0739  hypothetical protein  45.28 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  38.68 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0536  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  29.91 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  33.71 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  29.75 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  32.22 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1890  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198993  normal  0.263548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1046  hypothetical protein  28.26 
 
 		 274 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0293448  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2074  hypothetical protein  30.63 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6050  hypothetical protein  27.54 
 
 		 274 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0160776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3870  hypothetical protein  28.69 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.679069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3877  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  29.76 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  29.55 
 
 		 201 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>