20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7269 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7269  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6018  hypothetical protein  84.93 
 
 
106 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2616  hypothetical protein  71.95 
 
 
90 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.873704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2811  hypothetical protein  74.32 
 
 
87 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2588  hypothetical protein  74.32 
 
 
87 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3769  hypothetical protein  68.92 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.484717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3718  hypothetical protein  56.58 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0446271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1168  hypothetical protein  63.08 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0235  hypothetical protein  63.93 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4315  hypothetical protein  55 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165808  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4320  hypothetical protein  65.45 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153242  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1041  hypothetical protein  59.65 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4434  hypothetical protein  55 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4815  hypothetical protein  55 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471374  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4521  hypothetical protein  55 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4601  hypothetical protein  54.39 
 
 
69 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0792  hypothetical protein  56.67 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0058  hypothetical protein  54.1 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9013  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  58.49 
 
 
70 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9059  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  58.49 
 
 
70 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0953777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>