20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7138 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  77.53 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  54.32 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  54.43 
 
 
92 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  53.16 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  51.9 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  42.17 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  35.63 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  37.65 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  30.95 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  40.24 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  43.28 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  35.8 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2046  hypothetical protein  27.71 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343209  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2349  hypothetical protein  28.92 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000863109  normal  0.0220704 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  39.24 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  42.5 
 
 
89 aa  40.8  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>