21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6833 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6833    100 
 
 		 207 bp  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  89.54 
 
 		 1392 bp  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4242    86 
 
 		 306 bp  131  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.0765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  85.43 
 
 		 252 bp  125  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3934    86.08 
 
 		 509 bp  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1036    87.36 
 
 		 184 bp  77.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4389    90.57 
 
 		 144 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.730994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 1212 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3555  phage-associated protein, HI1409 family  100 
 
 		 2025 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0629    100 
 
 		 3052 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  91.43 
 
 		 567 bp  46.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 984 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 462 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>