18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2609 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2609  uncharacterized phage protein (possible DNA packaging)  100 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.501602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4286  hypothetical protein  97.87 
 
 		 94 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.285815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1290  phage protein DNA packaging protein  52.11 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4111  hypothetical protein  40.19 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1084  DNA packaging protein, putative  37.63 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1889  uncharacterized phage protein  41.43 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1723  phage protein  34.21 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.010366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2484  phage protein  36.26 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2022  phage protein  35.16 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0245  uncharacterized phage protein  36.73 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2234  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.219288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5156  hypothetical protein  43.06 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2244  hypothetical protein  32.38 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000199655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1627  uncharacterized phage protein  31.34 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1774  hypothetical protein  39.47 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>