18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0263 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  100 
 
 		 50 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  74.07 
 
 		 54 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  70.37 
 
 		 54 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  70.37 
 
 		 54 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2346  protein CoxF  88 
 
 		 50 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  70.45 
 
 		 54 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  54.35 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  59.09 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  46.34 
 
 		 46 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  50 
 
 		 55 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  51.16 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  46 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  41.46 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  47.92 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  47.92 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  50 
 
 		 56 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  50 
 
 		 56 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4645  protein CoxF  68.18 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0853547  normal  0.0948829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>