20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5175 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5175  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5556  membrane family protein  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5264  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10691  membrane protein mmpS5  76.06 
 
 		 142 aa  233  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3188  hypothetical protein  74.65 
 
 		 142 aa  227  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840906  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3434  membrane family protein  71.13 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1058  hypothetical protein  59.86 
 
 		 141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3028  membrane family protein  51.41 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10457  membrane protein mmpS4  49.64 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3834  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2704  membrane family protein  45.26 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10408  membrane protein mmpS1  43.06 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10517  membrane protein mmpS2  42.07 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6001  hypothetical protein  32.85 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000888837 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5600  hypothetical protein  32.85 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900171  normal  0.638938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6644  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3636  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3641  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3709  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12529  proline rich membrane protein  30.59 
 
 		 273 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0140931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>