16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4004 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  92.21 
 
 
121 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  82.5 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  71.95 
 
 
122 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  55.91 
 
 
106 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  47.19 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  53.54 
 
 
148 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  52.22 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  42.86 
 
 
125 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  39.82 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  32.77 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  46.27 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>