21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1912 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  994    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  46.57 
 
 
476 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  46.48 
 
 
484 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  42.86 
 
 
478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  40.17 
 
 
467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  39.62 
 
 
485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  41.63 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  39.63 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  36.03 
 
 
510 aa  289  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  34.22 
 
 
506 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  32.96 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  31.86 
 
 
474 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  31.08 
 
 
498 aa  223  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  27.59 
 
 
493 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  30.26 
 
 
463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  27.92 
 
 
506 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  26.42 
 
 
524 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  24.4 
 
 
519 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  23.34 
 
 
460 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  22.02 
 
 
373 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  28.86 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>