13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1457 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1457  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000018959  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0487  protein of unknown function DUF465  46.03 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  40.91 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1634  hypothetical protein  48.33 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03153  UptF  40.91 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.633136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  38.24 
 
 
71 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1705  UptF protein  46.67 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  38.1 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  36.36 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  39.39 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  30.43 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  33.8 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>