43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0828 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0828  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  168  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0115743  normal  0.291701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2392  protein of unknown function DUF526  35.82 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3655  hypothetical protein  39.73 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2405  hypothetical protein  37.66 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2784  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2867  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2922  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2253  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0436  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2878  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6196  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0406  hypothetical protein  43.14 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0650  hypothetical protein  43.14 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0194  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3219  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1399  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0467  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0486  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2826  hypothetical protein  43.14 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.865943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3773  protein of unknown function DUF526  40.32 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  32.1 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  35.62 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2390  hypothetical protein  30.26 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2020  protein of unknown function DUF526  30.26 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.271189  normal  0.774588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0238  hypothetical protein  38.18 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1665  protein of unknown function DUF526  36.49 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0255  hypothetical protein  41.18 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  32.5 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4191  hypothetical protein  38.18 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.975481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0524  protein of unknown function DUF526  38.18 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  35.48 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0289  hypothetical protein  40.82 
 
 
115 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0340  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  57.89 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2511  hypothetical protein  31.17 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.207429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5144  hypothetical protein  35.29 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1017  protein of unknown function DUF526  31.33 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0541508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4287  hypothetical protein  33.75 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  35 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0060  hypothetical protein  30.26 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0780  hypothetical protein  30.12 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000301907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2124  hypothetical protein  30.26 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5235  hypothetical protein  32.53 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>