13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0489 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0489  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1419  hypothetical protein  97.37 
 
 
304 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1217  hypothetical protein  96.38 
 
 
304 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1408  hypothetical protein  83.97 
 
 
313 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1204  hypothetical protein  75.5 
 
 
299 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.831823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0701  hypothetical protein  45.97 
 
 
310 aa  262  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.40192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2059  hypothetical protein  42.76 
 
 
313 aa  258  9e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.427395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0494  hypothetical protein  41.06 
 
 
307 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.866681  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1908  hypothetical protein  40.27 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2440  hypothetical protein  40.33 
 
 
312 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2305  hypothetical protein  42.05 
 
 
312 aa  235  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0549  hypothetical protein  40.4 
 
 
312 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.16548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0249  methanogenesis marker protein 7  39.74 
 
 
312 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>