38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0141 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  95.89 
 
 		 365 aa  706    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  97.26 
 
 		 365 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  90.96 
 
 		 365 aa  699    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  100 
 
 		 365 aa  749    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  80.83 
 
 		 363 aa  627  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  39.84 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.82 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.28 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  40.4 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.23 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  40.55 
 
 		 365 aa  259  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  39.55 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  39.44 
 
 		 362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  38.98 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  40.17 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  38.87 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  39.72 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  39.12 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  40 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  37.77 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  34.6 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  35.92 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  35.97 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  36.24 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  34.92 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  35.42 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  33.33 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  33.61 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  33.33 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  32.9 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  35.36 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.59 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  30.75 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  34.04 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  24.83 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  25.17 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  27.31 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  31.51 
 
 		 882 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>