27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2183 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2183  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0723  hypothetical protein  47.14 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.549756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0568  hypothetical protein  44.59 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0459  hypothetical protein  44.62 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.555176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0944  hypothetical protein  49.02 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0710  hypothetical protein  43.08 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0933302  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0524  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248456  normal  0.33753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2350  hypothetical protein  44.74 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1233  hypothetical protein  44.74 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3935  hypothetical protein  46.15 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2951  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4353  hypothetical protein  44.62 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107757  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1374  hypothetical protein  44.78 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3071  hypothetical protein  40.91 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2591  hypothetical protein  41.56 
 
 
84 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3300  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  0.761211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3107  hypothetical protein  36 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2030  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.979837  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1114  hypothetical protein  44.64 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3426  hypothetical protein  36 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0518  hypothetical protein  36.51 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2754  hypothetical protein  40.3 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0409  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2405  hypothetical protein  35.38 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.368426  normal  0.694477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0749  hypothetical protein  35.38 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0400  hypothetical protein  42.11 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4374  hypothetical protein  38.81 
 
 
77 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>