47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0723 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  100 
 
 
914 aa  1766    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  42.06 
 
 
939 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  40.04 
 
 
937 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  39.83 
 
 
937 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  39.9 
 
 
939 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  38.83 
 
 
949 aa  542  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  38.73 
 
 
948 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  38.1 
 
 
957 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  38.5 
 
 
942 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  39.12 
 
 
937 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  40.99 
 
 
929 aa  525  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  43.11 
 
 
941 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  39.53 
 
 
945 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  39.01 
 
 
941 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  40.06 
 
 
943 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  40.1 
 
 
940 aa  506  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  39.88 
 
 
943 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  40.81 
 
 
921 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  41.45 
 
 
939 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  39.47 
 
 
945 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  38.52 
 
 
941 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  40.04 
 
 
924 aa  489  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  40.78 
 
 
925 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  41.01 
 
 
925 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  38.43 
 
 
942 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  40.34 
 
 
939 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  37.95 
 
 
919 aa  482  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  40.69 
 
 
927 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  38.6 
 
 
941 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  34 
 
 
932 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  38.59 
 
 
958 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  38.7 
 
 
938 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  38.59 
 
 
937 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  38.68 
 
 
940 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  34.96 
 
 
892 aa  352  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3903  hypothetical protein  39.64 
 
 
639 aa  310  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.436608  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  46.56 
 
 
279 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  32.77 
 
 
280 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  34.96 
 
 
256 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  35.81 
 
 
256 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  35.81 
 
 
259 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  42.25 
 
 
720 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  39.44 
 
 
717 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  38.03 
 
 
717 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  38.03 
 
 
717 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  38.64 
 
 
872 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>