53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0401 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  100 
 
 
179 aa  344  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  38.46 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  32.52 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  32.93 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  33.54 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  32.52 
 
 
176 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  33.54 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  33.54 
 
 
183 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  28.29 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.68 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.83 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  31.71 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  28.66 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  27.52 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.61 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  30.52 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  28.07 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  25.71 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  31.45 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  31.45 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  26.71 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.71 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  30.26 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  26.85 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  26.85 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  31.65 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  25.5 
 
 
168 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  24.5 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.22 
 
 
184 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  26.97 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  27.78 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  28.3 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.78 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.87 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  30.48 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  33.65 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  25.69 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  22.22 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  22.22 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  23.49 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  25 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  26.83 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  29.48 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  25 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  28.86 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  25 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  29.3 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  30.48 
 
 
220 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>