13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0773 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  761    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  49.1 
 
 
344 aa  339  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  39.94 
 
 
515 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 
505 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
506 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 
509 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  37.92 
 
 
502 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
528 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  26.88 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  24.71 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 
237 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>