24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2412 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2365  putative export or membrane protein  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2412  putative export or membrane protein  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2406  putative export or membrane protein  99.4 
 
 
166 aa  333  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474426  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3745  putative export or membrane protein  68.86 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291225  normal  0.0249231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2662  putative export or membrane protein  66.87 
 
 
167 aa  236  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11411  hypothetical protein  61.59 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0169137  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2338  hypothetical protein  51.39 
 
 
184 aa  166  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5243  hypothetical protein  39.75 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2583  hypothetical protein  39.72 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15570  hypothetical protein  37.82 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.581223  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2264  hypothetical protein  42.14 
 
 
172 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4277  hypothetical protein  41.61 
 
 
174 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.333578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2001  hypothetical protein  37.25 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17980  hypothetical protein  35.57 
 
 
188 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1323  hypothetical protein  32.26 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.248263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2036  hypothetical protein  35.48 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1844  hypothetical protein  32.39 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.933293  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3200  hypothetical protein  34.97 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00811968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  32.06 
 
 
591 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2403  hypothetical protein  33.57 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14750  hypothetical protein  32.59 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.361385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3003  hypothetical protein  34.88 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12600  hypothetical protein  33.02 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0565366  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1710  hypothetical protein  30.61 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0354776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>