13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0909 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  100 
 
 
502 aa  1036    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 
505 aa  425  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  43.72 
 
 
509 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  40.08 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 
506 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  38.59 
 
 
344 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  37.92 
 
 
367 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  25.05 
 
 
528 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  24.35 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
242 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
263 aa  44.3  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
263 aa  43.5  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>